Одна часть музея посвящена лоцманскому промыслу, который был популярен в Мышкине в XIX веке, а в других экспозициях представлена история города и его знаменитых горожан: писателей, купцов и меценатов.
В прошлые века Мышкинские лоцманы были известны по всей реке Волге. Они знали речное русло как свои пять пальцев и умели беспрепятственно провести судно к месту назначения. Сегодня посетители музея могут увидеть старинные предметы, связанные с лоцманским ремеслом: якоря XIX века, рулевые колеса и рынды.
Музей лоцманов считается еще и краеведческим историко-бытовым музеем. Поэтому другая часть экспозиции посвящена истории и быту города: здесь посетители узнают об именитых купцах и дворянах Мышкина, увидят предметы быта горожан XIX века и даже артефакты первых людей на этой земле.
Особо ценными экспонатами музея считаются письменный стол Некрасова, книги историка и библиофила Опочинина и артефакты адмирала Ушакова.
На автомобиле во Ярославскому шоссе до Сергиева Посада, далее двигаться в сторону Углича, затем по указателям на Мышкин, далее ехать в центр города.